Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2AQ7L0J3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms