Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms