Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT89

SLC25A48, Solute carrier family 25 member 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A48Q6ZT89 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms