Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms