Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC55Q6ZSA7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms