Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HACD2Q6Y1H2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HACD2Q6Y1H2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HACD2Q6Y1H2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HACD2Q6Y1H2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HACD2Q6Y1H2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HACD2Q6Y1H2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HACD2Q6Y1H2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HACD2Q6Y1H2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HACD2Q6Y1H2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HACD2Q6Y1H2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD2Q6Y1H2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD2Q6Y1H2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD2Q6Y1H2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD2Q6Y1H2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD2Q6Y1H2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD2Q6Y1H2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD2Q6Y1H2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD2Q6Y1H2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD2Q6Y1H2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD2Q6Y1H2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD2Q6Y1H2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms