Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF7IPQ6VMQ6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms