Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASP12Q6UXS9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP12Q6UXS9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms