Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VITQ6UXI7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms