Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VSTM1Q6UX27 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms