Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABRAXAS1Q6UWZ7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms