Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SARM1Q6SZW1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms