Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TSSK4Q6SA08 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms