Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDF2Q6PJF5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDF2Q6PJF5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms