Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms