Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms