Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C22orf39Q6P5X5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms