Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms