Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6P435 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6P435 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6P435 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6P435 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6P435 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6P435 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6P435 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6P435 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6P435 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6P435 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6P435 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6P435 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6P435 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6P435 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6P435 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6P435 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6P435 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6P435 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6P435 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6P435 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6P435 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6P435 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6P435 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6P435 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6P435 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6P435 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6P435 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6P435 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6P435 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6P435 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6P435 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6P435 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6P435 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6P435 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6P435 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6P435 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6P435 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6P435 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6P435 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6P435 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6P435 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6P435 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6P435 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6P435 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6P435 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6P435 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6P435 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6P435 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6P435 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6P435 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6P435 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q6P435 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6P435 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6P435 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6P435 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6P435 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6P435 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6P435 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6P435 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6P435 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6P435 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6P435 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6P435 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6P435 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6P435 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6P435 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6P435 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6P435 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6P435 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6P435 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q6P435 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q6P435 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q6P435 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6P435 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6P435 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6P435 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6P435 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6P435 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6P435 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6P435 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6P435 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6P435 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6P435 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6P435 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6P435 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6P435 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6P435 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6P435 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6P435 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6P435 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6P435 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6P435 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6P435 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6P435 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6P435 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6P435 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6P435 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6P435 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6P435 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms