Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUT3

MFSD12, Major facilitator superfamily domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD12Q6NUT3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MFSD12Q6NUT3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MFSD12Q6NUT3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms