Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms