Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GDF6Q6KF10 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF6Q6KF10 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF6Q6KF10 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF6Q6KF10 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF6Q6KF10 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF6Q6KF10 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF6Q6KF10 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF6Q6KF10 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF6Q6KF10 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF6Q6KF10 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF6Q6KF10 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF6Q6KF10 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF6Q6KF10 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF6Q6KF10 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF6Q6KF10 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF6Q6KF10 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF6Q6KF10 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF6Q6KF10 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF6Q6KF10 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF6Q6KF10 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF6Q6KF10 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF6Q6KF10 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF6Q6KF10 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF6Q6KF10 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF6Q6KF10 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms