Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms