Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV3

PTRHD1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRHD1Q6GMV3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTRHD1Q6GMV3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms