Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM2

PCNX4, Pecanex-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4Q63HM2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNX4Q63HM2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
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