Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV67

PPRC1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPRC1Q5VV67 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PPRC1Q5VV67 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PPRC1Q5VV67 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.05
PPRC1Q5VV67 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.05
PPRC1Q5VV67 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPRC1Q5VV67 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPRC1Q5VV67 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPRC1Q5VV67 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPRC1Q5VV67 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPRC1Q5VV67 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPRC1Q5VV67 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPRC1Q5VV67 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPRC1Q5VV67 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPRC1Q5VV67 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPRC1Q5VV67 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPRC1Q5VV67 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPRC1Q5VV67 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPRC1Q5VV67 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPRC1Q5VV67 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPRC1Q5VV67 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPRC1Q5VV67 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPRC1Q5VV67 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPRC1Q5VV67 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PPRC1Q5VV67 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms