Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD1Q5VV17 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTUD1Q5VV17 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms