Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
WDR78Q5VTH9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms