Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q5VSD8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q5VSD8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q5VSD8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q5VSD8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q5VSD8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q5VSD8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q5VSD8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q5VSD8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q5VSD8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q5VSD8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q5VSD8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q5VSD8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q5VSD8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q5VSD8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q5VSD8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q5VSD8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q5VSD8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q5VSD8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q5VSD8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q5VSD8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q5VSD8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q5VSD8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q5VSD8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q5VSD8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q5VSD8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q5VSD8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q5VSD8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q5VSD8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q5VSD8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q5VSD8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q5VSD8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q5VSD8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q5VSD8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q5VSD8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q5VSD8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q5VSD8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q5VSD8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q5VSD8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q5VSD8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q5VSD8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q5VSD8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q5VSD8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q5VSD8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q5VSD8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q5VSD8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q5VSD8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q5VSD8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q5VSD8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q5VSD8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q5VSD8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q5VSD8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q5VSD8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q5VSD8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q5VSD8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q5VSD8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q5VSD8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q5VSD8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q5VSD8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q5VSD8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q5VSD8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q5VSD8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q5VSD8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q5VSD8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q5VSD8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q5VSD8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q5VSD8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q5VSD8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q5VSD8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q5VSD8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q5VSD8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q5VSD8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q5VSD8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q5VSD8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q5VSD8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms