Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C12orf60Q5U649 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms