Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T1

TMEM170B, Transmembrane protein 170B, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM170BQ5T4T1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM170BQ5T4T1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM170BQ5T4T1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms