Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZD1

C6orf141, Uncharacterized protein C6orf141, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf141Q5SZD1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C6orf141Q5SZD1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C6orf141Q5SZD1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms