Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NHSL1Q5SYE7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NHSL1Q5SYE7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms