Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms