Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRDTQ58F21 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRDTQ58F21 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
BRDTQ58F21 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRDTQ58F21 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRDTQ58F21 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRDTQ58F21 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRDTQ58F21 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRDTQ58F21 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRDTQ58F21 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRDTQ58F21 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRDTQ58F21 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRDTQ58F21 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRDTQ58F21 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRDTQ58F21 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRDTQ58F21 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRDTQ58F21 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRDTQ58F21 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRDTQ58F21 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms