Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
KLHL12Q53G59 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL12Q53G59 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 521.6 ms