Protein–RNA interactions for Protein: Q4JDL3

PTPN20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN20Q4JDL3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN20Q4JDL3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN20Q4JDL3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN20Q4JDL3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN20Q4JDL3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN20Q4JDL3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN20Q4JDL3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN20Q4JDL3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN20Q4JDL3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN20Q4JDL3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN20Q4JDL3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN20Q4JDL3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN20Q4JDL3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN20Q4JDL3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN20Q4JDL3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN20Q4JDL3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN20Q4JDL3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN20Q4JDL3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN20Q4JDL3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN20Q4JDL3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN20Q4JDL3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN20Q4JDL3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN20Q4JDL3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN20Q4JDL3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN20Q4JDL3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN20Q4JDL3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN20Q4JDL3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN20Q4JDL3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN20Q4JDL3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN20Q4JDL3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN20Q4JDL3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms