Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCM7

TUBB8, Tubulin beta-8 chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB8Q3ZCM7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBB8Q3ZCM7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBB8Q3ZCM7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB8Q3ZCM7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB8Q3ZCM7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms