Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD55Q3KP44 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms