Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
VWC2Q2TAL6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms