Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPEL1Q2QD12 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RPEL1Q2QD12 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPEL1Q2QD12 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPEL1Q2QD12 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPEL1Q2QD12 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPEL1Q2QD12 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPEL1Q2QD12 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPEL1Q2QD12 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPEL1Q2QD12 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPEL1Q2QD12 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPEL1Q2QD12 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RPEL1Q2QD12 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPEL1Q2QD12 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms