Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms