Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC142Q17RM4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC142Q17RM4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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