Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR2Q16832 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDR2Q16832 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms