Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2B3Q16720 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms