Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FSCN1Q16658 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
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