Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMN1Q16637 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMN1Q16637 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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