Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ECM1Q16610 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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