Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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SSX2Q16385 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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