Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1AQ15573 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1AQ15573 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1AQ15573 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1AQ15573 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1AQ15573 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1AQ15573 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1AQ15573 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1AQ15573 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1AQ15573 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1AQ15573 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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